محمود واعظی، رئیس دفتر رئیس جمهور در دوره روحانی، گفت: دبیرخانه شورای عالی امنیت ملی (علی شمخانی) به صورت عجیبی در تنظیم و تصویب قانون اقدام راهبردی مجلس که روحانی مخالف آن بود، نقش داشت.

در فیلمی که انتخاب از این گفتگو منتشر کرده، محمود واعظی می گوید: دولت هم اطلاعی در این زمینه نداشت و آقای روحانی از ابتدا مخالف آن بود.  

واعظی درمورد تغییر شمخانی در همان زمان نیز گفت: روحانی چند بار نظرش را به رهبری منتقل کرد که فرد دیگری دبیر شود اما رهبری گفتند فعلا باشد.