آهنگسازی موسیقی متن سریال مختارنامه بر عهدهٔ امیر توسلی بوده است. او برای ضبط موسیقی این سریال از ارکستر 130 نفره در تالار رودکی استفاده کرد که برای نخستینبار در ایران چنین ترکیبی برای یک اثر تلویزیونی به کار گرفته شد. موسیقی این سریال بهصورت پلان به پلان طراحی شده و با دقت فراوانی تنظیم شده است.
ویدئویی از اجرای زندهی آهنگ معروف سریال «مختارنامه» توسط گروه موسیقی جوان در یکی از کنسرتها، بهتازگی در فضای مجازی منتشر شده و توجه بسیاری از کاربران را به خود جلب کرده است. این اجرا که با تنظیمی متفاوت و حالوهوایی تازه همراه بود، با استقبال گسترده مخاطبان روبهرو شده و بارها در شبکههای اجتماعی بازنشر شده است. کاربران با تحسین توانایی و احساس گروه اجراکننده، از بازآفرینی این قطعه خاطرهانگیز استقبال کردهاند.